HDO er plassert på Gjøvik. Foretaket er delt inn i 2 avdelinger: avdeling for Kunde- og tjenesteforvaltning og avdeling for Drift og endringer. I tillegg har HDO to staber; Stab for strategi og virksomhetsstyring, samt stab for Økonomi innkjøp, administrasjon og HR.
Foretaket har fire eiere: Helse Sør-Øst RHF, Helse Nord RHF, Helse Midt-Norge RHF og Helse Vest RHF, hvorav eierandelene er på 40 prosent til Helse Sør-Øst RHF og 20 prosent hver til de tre andre RHFene.
Organisasjonskart
Administrerende direktør er Lars Erik Tandsæther.
Videre består ledelsen i HDO av;
- Direktør - Strategi og virksomhetsstyring; Ketil Are Lund
- Administrasjonssjef - Økonomi, innkjøp, administrasjon og HR; Rune Wester
- Avdelingsleder - Kunde- og tjenesteforvaltning; Vegar Hermansson
- Avdelingsleder - Drift og endringer; Anita Østlund